123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475767778798081828384858687888990919293949596979899100101102103104105106107108109110111112113114115116117118119120121122123124125126127128129130131132133134135136137138139140141142143144145146147148149150151152153154155156157158159160161162163164165166167168169170171172173174175176177178179180181182183184185186187188189190191192193194195196197198199200201202203204205206207208209210211212213214215216217218219220221222223224225226227228229230231232233234235236237238239240241242243244245246247248249250251252253254255256257258259260261262263264265266267268269270271272273274275276277278279280281282283284285286287288289290291292293294295296297298299300301302303304305306307 |
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- <Param val="import os&#10;import datetime&#10;from time import sleep&#10;import argparse&#10;&#10;from device.data_client import NeuracleDataClient&#10;from device.trigger_box import TriggerNeuracle&#10;from device.fubo_pneumatic_finger import FuboPneumaticFingerClient&#10;from settings.config import settings&#10;from bci_core.online import Controller, model_loader&#10;from settings.config import settings&#10;&#10;&#10;config_info = settings.CONFIG_INFO&#10;fingermodel_ids_inverse = settings.FINGERMODEL_IDS_INVERSE&#10;&#10;# get train params&#10;def parse_args():&#10; parser = argparse.ArgumentParser(&#10; description='Hand gesture train'&#10; )&#10; parser.add_argument(&#10; '--subj',&#10; dest='subj',&#10; help='Subject name',&#10; default=None,&#10; type=str&#10; )&#10; parser.add_argument(&#10; '--com',&#10; dest='com',&#10; help='Peripheral serial port',&#10; type=str&#10; )&#10; parser.add_argument(&#10; '--state-change-threshold',&#10; '-scth',&#10; dest='state_change_threshold',&#10; help='Threshold for HMM state change',&#10; type=float&#10; )&#10; parser.add_argument(&#10; '--state-trans-prob',&#10; '-stp',&#10; dest='state_trans_prob',&#10; help='Transition probability for HMM state change',&#10; default=0.8,&#10; type=float&#10; )&#10; parser.add_argument(&#10; '--model-path',&#10; dest='model_path',&#10; help='Path to model file',&#10; default=None,&#10; type=str&#10; )&#10; return parser.parse_args()&#10;args = parse_args()&#10;&#10;# load model&#10;input_kwargs = {&#10; 'state_trans_prob': args.state_trans_prob,&#10; 'state_change_threshold': args.state_change_threshold&#10; }&#10;control_model = model_loader(args.model_path, **input_kwargs)&#10;&#10;# build bci controller&#10;controller = Controller(0., control_model)" valType="extendedCode" updates="constant" name="Before Experiment"/>
- <Param val="force = 0;&#10;" valType="extendedCode" updates="constant" name="Before JS Experiment"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Begin Experiment"/>
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- <Param val="parameter_inputs" valType="code" updates="None" name="name"/>
- </CodeComponent>
- <CodeComponent name="device" plugin="None">
- <Param val="# connect neo&#10;receiver = NeuracleDataClient(n_channel=len(config_info['channel_labels']), &#10; samplerate=config_info['sample_rate'],&#10; host=config_info['host'],&#10; port=config_info['port'],&#10; buffer_len=config_info['buffer_length'])&#10;&#10;# connect to trigger box&#10;trigger = TriggerNeuracle()&#10;&#10;# connect to mechanical hand&#10;hand_device = FuboPneumaticFingerClient({'port': args.com})&#10;" valType="extendedCode" updates="constant" name="Before Experiment"/>
- <Param val="receiver = new NeuracleDataClient({"n_channel": config_info["channel_labels"].length, "samplerate": config_info["sample_rate"], "host": config_info["host"], "port": config_info["port"]});&#10;trigger = new TriggerNeuracle();&#10;hand_device = new FuboPneumaticFingerClient({"port": args.com});&#10;controller = new Controller(0.0, args.model_path, {"state_change_threshold": 0.8});&#10;" valType="extendedCode" updates="constant" name="Before JS Experiment"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Begin Experiment"/>
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- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Begin JS Routine"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Begin Routine"/>
- <Param val="Py" valType="str" updates="None" name="Code Type"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Each Frame"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="Each JS Frame"/>
- <Param val="receiver.close()" valType="extendedCode" updates="constant" name="End Experiment"/>
- <Param val="receiver" valType="extendedCode" updates="constant" name="End JS Experiment"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="End JS Routine"/>
- <Param val="" valType="extendedCode" updates="constant" name="End Routine"/>
- <Param val="False" valType="bool" updates="None" name="disabled"/>
- <Param val="device" valType="code" updates="None" name="name"/>
- </CodeComponent>
- </Routine>
- </Routines>
- <Flow>
- <Routine name="initialize"/>
- <LoopInitiator loopType="TrialHandler" name="trials">
- <Param name="Selected rows" updates="None" val="" valType="str"/>
- <Param name="conditions" updates="None" val="None" valType="str"/>
- <Param name="conditionsFile" updates="None" val="" valType="file"/>
- <Param name="endPoints" updates="None" val="[0, 1]" valType="num"/>
- <Param name="isTrials" updates="None" val="True" valType="bool"/>
- <Param name="loopType" updates="None" val="random" valType="str"/>
- <Param name="nReps" updates="None" val="10000" valType="num"/>
- <Param name="name" updates="None" val="trials" valType="code"/>
- <Param name="random seed" updates="None" val="" valType="code"/>
- </LoopInitiator>
- <Routine name="decision"/>
- <Routine name="feedback"/>
- <LoopTerminator name="trials"/>
- </Flow>
- </PsychoPy2experiment>
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